Dr. Drs. Yunus Busa, M.Si. Rektor dipilih oleh anggota senat universitas muhammadiyah enrekangda disetujui oleh Pimpinan Pusat Muhammadiyah. sesuai dengan Qoidah Perguruan Tinggi Muhammadiyah, Masa jabatan Rektor adalah selama 14 tahun selama 4 Periode, sebelum berubah bentuk ke Universitas Rektor Menjabat 3 Periode Sebagai Ketua STKIP Muhammadiyah Enrekang.
Dalam keseharian, Rektor dibantu oleh Pembantu Wakil Rektor I ( Bidang Akademik dan SDM ), Wakil Rektor II (Bidang Sarana dan Prasarana, Keuangan dan Kekayaan) dan Wakil Rektor III (Bidang Kemahasiswaa dan Kerjasama)
Kegiatan sehari-hari rektor dikelola oleh Sekretariat Rektor yang terdiri dari Kepala Sekretariat yang dibantu tiga orang staf. Kami di sekretariat rektor berusaha mengelola kegiatan rektor terkait dengan urusan administrasi, agenda, perjalanan dinas, dan lain-lain. Selain itu, kami juga memfasilitasi komunikasi dengan kolega-kolega yang berurusan dinas dengan rektor.
Kantor kami berlokasi di Gedung Rektorat di Kampus I UNIMEN, Jl. Jenderal Sudirman, No. 17 Enrekang , lantai 1. Untuk komunikasi dapat menghubungi nomor telepon 00000,- Ext. 101 pada jam kerja atau di nomor telepon seluler +62 81 233 943 49